Hola, segurament si que estan en el mateix sistema de referència, pero al imprimir en PDF normalment es sol deformar un poc la imatge d'impreció. tens el mapa en img o tif? amb un programa SIG es pot intentar fer una georreferenciació, es a dir, posar uns quants punts de control amb coordenades conegudes sobre la imatge i identificarlos amb els homòlegs, d'aquesta manera es podria corregir la imatge per a que encaixara amb altres tipus d'informació i tinguera el seu sistema de referencia correcte. Jo els shapes de municipis, comarques, províncies y comunitat si els tinc, si vols t'els puc passar, o si em passes la imatge, aquest cap de setmana puc mirar a vore si la pose al lloc.